Funkce izolátorů je směrová, jak bylo zjištěno při pokusech s ovocnými muškami. gypsy byl vložen do žlutého lokusu y Drosophila melanogaster, což vedlo k inaktivaci genu y v některých tkáních, ale gen y byl v některých tkáních stále aktivní, protože na jednom konci gypsy byla sekvence izolátoru. cikán bude mít různé účinky na genovou aktivitu, když je cikán vložen na různá místa v lokusu y. Je to proto, že aktivita genu y je regulována čtyřmi zesilovači. Když je izolátor vložen těsně upstream od promotoru, blokuje aktivaci genů v tkáni lopatky křídla a kutikuly těla (z upstream enhanceru). Ale neblokoval expresi genu y (z downstream enhanceru) ve štětinách a farsálních drápech.
Protože některé zesilovače jsou upstream a některé downstream od promotoru, účinek izolátoru nezávisí na poloze izolátoru vzhledem k promotoru. Proto není důvod pro směrovost účinku izolátoru skutečně pochopen. Bylo zjištěno, že dva lokusy ovlivňují funkci izolátoru transaktivačním způsobem. Nukleoprotein kódovaný genem S2J(Hw) rozpozná izolátor a až poté, co se na něj izolátor naváže, má izolační účinek. Když je tento gen mutován, izolační efekt se ztrácí navzdory vložení izolátoru do lokusu y a y je exprimován ve všech tkáních. Dalším locusem je mod(mdg 4). Po mutaci tohoto genu je jeho účinek přesně opačný než Su(Hw), to znamená, že tyto mutanty zesilují izolační účinek, čímž se izolační účinek izolátoru již nesměřuje a expanduje, to znamená, že blokuje účinek zesilovačů na oba. strany proti proudu a po proudu.
